舟山医院由原舟山市人民医院、市妇幼保健院和市中医骨伤联合医院于2009年5月12日组建而成，是一家集医疗、科研、教学、预防、康复为一体的三级甲等综合医院。

医院占地382亩，建筑面积25万平方米，下设总部、定海院区与中医骨伤院区。现有在编职工2417人，其中正高131人，副高353人，硕博士170人。拥有国家特殊津贴专家3人，省“151工程”人才8人，市专业技术拔尖人才7名，市级有突出贡献专业人才4名。开设40个病区，实际开放床位1600张，95个专科。年门急诊240万人次，入院6.3万人次，手术2.7万例次。医院拥有1.5T西门子核磁共振仪2台、64排GE螺旋等CT机4台、全套CR/DR、PACS系统、直线加速器等大型医疗仪器。

经过几代舟医人辛勤耕耘，医院各学科在疾病的诊治方面形成了各自的特色和优势，部分诊疗技术已经达到国内先进水平并与国际接轨。能施行体外循环下心脏多瓣膜置换、复杂先心矫治术、心脏冠脉搭桥术、肝移植、脑干肿瘤摘除、关节置换、颈椎手术、冠脉完全闭塞病变的PTCA术、经尿道前列腺等离子体剜除术与多脏器DSA介入诊疗手术，开展了经脑室镜、胸腔镜、腹腔镜、十二指肠镜、宫腔镜等多种内腔镜下微创手术，多项达到省内先进水平。尤其是微小肺癌的研究与治疗，处于全国领先水平。

医院设有肺肿瘤诊疗中心、肝胆胰治疗中心、乳腺病治疗中心、肿瘤化疗中心、创伤中心和生殖医学中心等。临床学科中拥有国家中管局“十一五”重点专科建设项目1个，省级医学重点扶植学科1个，市级医学重点学科4个，省级示范中医科1个，省中管局重点专科建设项目3个，局级医学重点学科8个。建有细胞分子生物实验室、血液病实验室和骨科实验室。舟山市急救中心、舟山市名中医馆、舟山市惠民医院以及10个市级医疗质控中心挂靠于我院。是温州医科大学的附属医院和佳木斯大学研究生联合培养基地，也是华中科技大学同济医学院、浙江中医药大学、吉林医药学院、蚌埠医学院等高等医学院校的临床实习基地。